新战国时代，忍者们展开着与妖怪们激烈的战斗。以战斗末了，猿飞佐助为首的5人的忍者们，在自无敌将军们三神将被给予的「封印的门」中关锁妖怪总司令和妖怪们的能源的，事上成功了。丢失能源并在人类社会融洽了

　　1999年一个名为巴勒莱亚的邪恶机械帝国于月球建立了基地并向地球上的人类宣战。多个国家的大城市都被巴勒莱亚的先头部队所炸毁而日本正是下一个目标。 但人类不会屈服于这种威胁，

　　一条寺烈在地球上表面上只是在马场工作的一个普通人类；实际上，他的真正身份是接受了银河联邦警察的任命到地球担任防卫工作，打击宇宙犯罪组织的银色宇宙刑事－－卡邦　　卡邦要面对的

　　由大帝王GUBIRA所率領的暗黑銀河最大犯罪組織-不思議界FUMA，對銀河展開全面的侵攻；而地球也不例外。就在此時，巴特星的宇宙刑事養成所正在培育的刑事們奮起抵抗，而其中一

　　随着宇宙刑事卡邦的活跃，宇宙犯罪组织马克党被彻底摧毁，宇宙得到了暂时的和平。但是，虽然马克覆灭了，宇宙仍然存在着各类以称霸全宇宙为目的地犯罪组织。其中一个就是以幻梦界为据点

　　在与戈鲁戈姆战斗后半年，本应取回的和平突然被怪魔界克萊西斯帝国打破。克萊西斯帝国的杰克将军想拉拢南光太郎作为部下，但光太郎不答应，于是杰克将军便将其变身机能破坏　　变身机能

南光太郎和秋月信彦在一个日食的日子出生、并且以兄弟的身份被扶养长大信彦的父亲，秋月总一郎是秘密组织戈鲁戈姆的成员之一。在光太郎和信彦19岁生日那天，两人被这个秘密组织捉去改造成

在与戈鲁戈姆战斗后半年，本应取回的和平突然被怪魔界克萊西斯帝国打破克萊西斯帝国的杰克将军想拉拢南光太郎作为部下，但光太郎不答应，于是杰克将军便将其变身机能破坏。　　变身机能破坏